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SMART-Seq Single Cell Kit榮獲生物通2019十大創(chuàng)新產(chǎn)品大獎

Takara的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析試劑盒SMART-Seq Single Cell Kit不負(fù)眾望，獲評生物通2019生命科學(xué)十大創(chuàng)新產(chǎn)品！

>>為什么這個(gè)試劑盒能榮獲此殊榮，以下內(nèi)容告訴你答案！<<

SMART-Seq Single Cell Kit（Code: 634470）

該試劑盒基于SMART-Seq技術(shù)進(jìn)行優(yōu)化改良，具有更高的靈敏度和再現(xiàn)性，非常適合用于單細(xì)胞（尤其是RNA含量非常低的細(xì)胞，如PBMC）RNA-Seq的研究，不僅可用于差異表達(dá)分析，也可用于融合基因，可變剪切等研究。更，更，更需要強(qiáng)調(diào)的是，優(yōu)化升級的它，優(yōu)于許多現(xiàn)有的單細(xì)胞全長cDNA合成方法，比如SMART-Seq2技術(shù)。

不信你往下看

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——————————Round 1——————————

SMART-Seq Single Cell VS SMART-Seq2

好技術(shù)不是靠說的，而是用來驗(yàn)證的--Takara實(shí)驗(yàn)案例展示

本次Takara Bio USA以淋巴母細(xì)胞系GM12878單細(xì)胞為樣本制備文庫，分別采用SMART-Seq Single Cell Kit(SSsc)和SMART-Seq2法（Smart-seq2）合成cDNA（均進(jìn)行19個(gè)PCR循環(huán)擴(kuò)增），然后制備RNA-Seq文庫并進(jìn)行測序分析（所有樣本都均一化至1.75M paired-end reads）。

Panel A 相比而言，SSsc檢測到基因鑒別的reads數(shù)相對Smart-seq2較多。
Panel B SSsc能檢測到比Smart-seq2更多的基因。
Panel C與Smart-seq2方法相比，SSsc的重復(fù)性更好。
Panel D 當(dāng)TPM >1，SSsc檢測到更低的Dropouts比率，也證明了SSsc更高的再現(xiàn)性。

——————————Round 2——————————

SMART-Seq Single Cell VS SMART-Seq2

真實(shí)的用戶反饋，才能更加安心--用戶實(shí)例分享

巴塞羅那國家基因組分析中心的團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人Holger Heyn博士，之前他一直在使用SS2。但也和其他許多SS2用戶一樣，也期望有現(xiàn)成的、經(jīng)過驗(yàn)證的、再現(xiàn)性和靈敏度更高的產(chǎn)品可以使用。因此在SSsc推出時(shí)，Holger Heyn博士立即進(jìn)行了SMART-Seq Single Cell Kit(SSsc)和SMART-Seq2法（Smart-seq2）的對比實(shí)驗(yàn)。
本次實(shí)驗(yàn)，選取了RNA含量較低的B細(xì)胞和T細(xì)胞為樣本制備文庫，分別采用SSsc和SS2合成cDNA，且均分別進(jìn)行23個(gè)(Condition 1) 和25個(gè)(Condition 2) PCR循環(huán)擴(kuò)增。Holger Heyn博士指出，雖然SSsc和SS2的電泳圖結(jié)果比較接近，但SSsc的 cDNA產(chǎn)量更高。并且在23個(gè)PCR循環(huán)和25個(gè)PCR循環(huán)，SS2的read mapped比率有顯著差異（圖1）。這表明，操作流程中的微小變化對SS2文庫的可重復(fù)性也有顯著影響。

除了read mapped比率外，實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示的另一個(gè)關(guān)鍵指標(biāo)：基因檢測數(shù)方面SSsc也勝過SS2。在相同樣本起始情況下，SS2制備的文庫平均能檢測到約400個(gè)基因，而SSsc能鑒別的基因數(shù)至少是SS2的約5倍（圖2），這說明SSsc提供了更高的靈敏度!

以上數(shù)據(jù)都證明了，經(jīng)過優(yōu)化和驗(yàn)證且根據(jù)嚴(yán)格的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)生產(chǎn)的SMART-Seq Single Cell Kit，能獲得比SS2更高的靈敏度和更高的cDNA產(chǎn)量，更值得您的青睞！

關(guān)聯(lián)閱讀：SMART-Seq Single Cell Kit

頁面更新：2020-01-21 10:48:32

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