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機(jī)構(gòu)用戶解決方案

產(chǎn)品選擇指南

技術(shù)服務(wù)信息

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高起始量鏈特異RNA-Seq分析SMART-Seq® Total RNA High Input (RiboGone™ Mammalian)
品牌 Code No. 產(chǎn)品名稱 包裝量 價(jià)格(元) 說明書 數(shù)量
Clontech 635046 SMART-Seq® Total RNA High Input (RiboGone™ Mammalian) 24 Rxns ¥13,664
Clontech 635047 SMART-Seq® Total RNA High Input (RiboGone™ Mammalian) 96 Rxns ¥45,547
Clontech 635045 SMART-Seq® Total RNA High Input (RiboGone™ Mammalian) 4 x 96 Rxns ¥166,772
Clontech 634756 Unique Dual Index Kit (1–24) 24 Rxns ¥2,737
Clontech 634752 Unique Dual Index Kit (1–96) 96 Rxns ¥7,370
Clontech 634753 Unique Dual Index Kit (97–192) 96 Rxns ¥7,370
Clontech 634754 Unique Dual Index Kit (193–288) 96 Rxns ¥7,370
Clontech 634755 Unique Dual Index Kit (289–384) 96 Rxns ¥7,370
無標(biāo)題文檔
SMART-Seq® Total RNA High Input (RiboGone™ Mammalian)
· 保留鏈來源信息:轉(zhuǎn)錄本的鏈來源識(shí)別準(zhǔn)確率>99%
· 快速,簡(jiǎn)便流程:整個(gè)文庫構(gòu)建流程僅需5 h
· 起始范圍廣:適用于人,小鼠或大鼠100 ng-1 μg總RNA
· 樣本兼容性廣:兼容不同品質(zhì)RNA,不同重復(fù)之間均可獲得可靠數(shù)據(jù)。RIN值3-10的總RNA均可獲得高質(zhì)量重復(fù)數(shù)據(jù)
· 適用Illumina測(cè)序平臺(tái):最多支持同時(shí)構(gòu)建384 UDI測(cè)序文庫
注:本試劑盒不含index,可搭配使用Unique Dual Index (UDI) kits(單獨(dú)銷售)
 
■ 產(chǎn)品說明
SMART-Seq® Total RNA High Input (RiboGone™ Mammalian)可以提供從100 ng–1 μg哺乳動(dòng)物總RNA構(gòu)建Illumina測(cè)序文庫的解決方案。本試劑結(jié)合了RiboGone和SMART技術(shù),可以無縫融合rRNA去除和鏈特異性文庫構(gòu)建過程。
由于rRNA約占總RNA的90%,在文庫構(gòu)建前高效去除這些高豐度轉(zhuǎn)錄本可以降低測(cè)序成本,提升數(shù)據(jù)比對(duì)率。核心SMART技術(shù)可以在RT和PCR擴(kuò)增過程中添加index和測(cè)序接頭,無需下游文庫構(gòu)建,并且可以保留鏈來源信息。
 
不同樣品起始量解決方案
· 250 pg-10 ng總RNA,推薦使用 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2- Pico Input Mammalian
· 10-100 ng總RNA,推薦使用SMART-Seq Total RNA Mid Input
 
■ 建庫原理
A:利用RiboGone技術(shù)從總RNA樣品中去除rRNA
B:利用SMART技術(shù)合成第一鏈cDNA
C:通過PCR擴(kuò)增生成測(cè)序文庫
 
■ 不同品質(zhì)的樣本均可獲得可靠的結(jié)果
選擇不同品質(zhì)(RIN3和RIN7)的小鼠肝臟RNA樣本,分別以100 ng和1 μg的樣本量起始,使用該試劑盒制備RNA-Seq文庫。結(jié)果顯示,不同起始量,不同品質(zhì)的樣本之間的測(cè)序mapping率以及基因檢測(cè)數(shù)的差距不大。而且轉(zhuǎn)錄本的鏈識(shí)別率均在95%以上。
 
■ 再現(xiàn)性高
(1)樣本重復(fù)之間的一致性
以100 ng的HURR樣本起始,兩次生物學(xué)重復(fù),制備RNA-seq文庫。散點(diǎn)圖說明,兩個(gè)重復(fù)之間的FPKMs的相關(guān)性高。
 
(2)不同品質(zhì)RNA樣本之間的一致性
選擇不同品質(zhì)(RIN3和RIN7)的小鼠肝臟RNA樣本,以1 μg的樣本量起始,分別使用該試劑盒制備RNA-Seq文庫。散點(diǎn)圖說明,不同品質(zhì)RNA樣本之間的FPKMs的相關(guān)性高。
 
注:
SMART-Seq® Total RNA High Input (RiboGone™ Mammalian)是SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian的等效替代品。只有如下細(xì)微變動(dòng),本次更新并不影響這些試劑盒的流程和性能。
· 靈活的選擇:試劑盒中不包含index,但也可以與Unique Dual Index (UDI) kits搭配使用。
 
 
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頁面更新:2024-01-12 10:44:59

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