使用本試劑盒要特別注意干燥步驟。因為該方法提取的DNA較大,完整性好,所以請一定不要干燥過度。Tube中看不到有明顯的液體或沒有乙醇氣味后,就可以加入TE Buffer進行溶解。如果沉淀已經(jīng)變白,說明干燥過度,此時加入TE Buffer,可能沉淀不能完全溶解,DNA的收量可能會受到影響。
本試劑盒適合于動物組織、一般植物材料、全血、培養(yǎng)細胞、革蘭氏陰性菌的基因組DNA提取?;蚪MDNA的提取量根據(jù)組織材料的不同而各異,一般情況下,從10 mg的肝臟組織中,可以提取約5 μg的基因組DNA;從100 mg的菠菜中,可以提取約5 μg的基因組DNA;從100 μl的人全血中,可以提取約0.5 μg的基因組DNA;從2.0E+06的培養(yǎng)細胞中,可以提取約10 μg的基因組DNA;從2.0E+09的E.coli細胞中,可以提取約10 μg的基因組DNA。
基因組DNA收量較低時,可以從以下幾個方面考慮:
① 實驗材料量太少,比如從2×103培養(yǎng)細胞中提取的基因組DNA就不能用電泳檢測到;
② 裂解不充分,DNA未充分釋放,建議要延長裂解時間(過夜裂解)或增加裂解液的量;
③ 提取的組織材料中基因組DNA含量較少,適當增加起始組織量;
④ 起始組織量過大,裂解困難,按比例適當增加裂解液的加量或分成多份進行提??;
⑤ 洗脫時將滅菌蒸餾水或Elution Buffer加熱至65℃后使用將有利于提高洗脫效率;
⑥ 請嚴格按照操作方法進行操作。
① 選取的實驗材料不夠新鮮,采集后的組織材料未及時處理或未低溫保存。我們建議材料應(yīng)盡量在-80℃保存,運輸過程中亦應(yīng)使用干冰等。
② 材料本身有殘留的DNA酶活性??梢栽黾右淮蜝uffer WA的清洗操作。
① 實驗過程中沒有使用RNase A。應(yīng)嚴格按照實驗操作要求使用RNase A。
② RNase A可能失活。RNase A盡可能在-20℃下保存,RNase A活性比較穩(wěn)定,一般不易失活。
① 提取的基因組DNA中鹽份濃度過高。在使用Buffer WA和Buffer WB進行DNA制備膜的清洗時,請沿Spin Column的管壁四周加入,且加入Buffer WB后室溫靜置5分鐘,有助于徹底清洗掉Column上殘留的鹽離子,這樣有利于提高清洗效果。
② 洗脫液中殘留乙醇,在向Column中加入洗脫液之前,將Column在室溫下靜置2分鐘有助于使Column上殘留的乙醇徹底揮發(fā),然后再加入洗脫液洗脫。
③ 進行DNA洗脫時請一定在膜的中央加入洗脫液,盡量不要沾染Spin Column的管壁四周。
本試劑盒主要用于小量基因組DNA的制備,當實驗材料量超出說明書的要求用量時,可以加大Buffer GL或Buffer GB的用量,裂解后分到兩個Collection Tube中進行實驗操作。起始組織量最好控制在規(guī)定范圍內(nèi),可以分幾份進行,否則起始量過大會影響裂解和收量,如果裂解不充分會堵塞柱子,造成實驗失敗。
有的深加工品材料本身DNA含量非常少,并且加工之后導致DNA斷裂,所以電泳時可能檢測不到明顯的DNA條帶,可以直接進行PCR檢測。
頁面更新:2020-04-29 11:42:46